D’après le JORT N°64 du 5 août 2016, Youssef Néji a été nommé par la présidence du gouvernement au poste de directeur général du centre de documentation nationale (CDN).
Youssef Néji avait occupé plusieurs postes. En août 1999, il est nommé premier délégué dans le gouvernorat de Kairouan et occupe le même poste, en août 2002, dans le gouvernorat de l’Ariana. En avril 2003, Kamel Néji est nommé gouverneur de la Manouba avant d’assumer en novembre 2004, les fonctions de président directeur général de TUNISAIR.
Le 1er février 2007, il est nommé PDG du Cepex.